1、立枯病，幼苗期均可发病，病苗茎基变褐，茎叶萎垂枯死，稍大幼苗白天萎蔫，夜间恢复，当病斑绕茎一周时，幼苗逐渐枯死，一般不倒伏，主要危害大苗或育苗番茄的茎基部或地下侧根，病部初呈暗褐色，后绕茎基或根茎扩展，致皮层腐烂，果实膨大后因养分供不应求逐渐萎蔫枯死。主要通过水流和农具传播，还有播种过密、光照不足、温度过高容易引发该病。

防治措施：加强苗床管理，注意提高地温，科学放风，防止苗床或育苗盘高温，高湿条件出现。苗期喷施芸苔素内酯水剂增强植株抗病力。发病初期喷淋甲基硫菌灵悬浮剂或恶霉灵水剂。要是猝倒病和立枯病同时发生时，可以用醚菌酯悬浮剂视病情间隔7-10天一次，连续防治2-3次。

2、番茄枯萎病

番茄枯萎病是番茄的一种土传病害。各地均有分布，对产量造成很大的损失，该病一般在开花结果期开始发病，病初的时候茎侧下向上出现凹陷区，使一侧叶片发黄，变褐后枯死，有的半个叶序或半边叶变黄，也有的从植株距地面近的叶序始发，逐渐向上蔓延，除顶端数片叶完好外，其余都枯死。一般从幼根或伤口侵入寄主，还有通过水流或灌溉水传播蔓延，土温28度、土壤潮湿、连作地、移栽或者中耕时伤口很多，植株生长势弱的田块发病重，还有酸性土壤以及线虫取食造成的伤口有利于本病发生。

防治措施：选用耐病品种，轮作倒茬，一般应轮作3年以上。使用充分腐熟的有机肥，采用配方施肥技术，配合微生物菌剂一块使用，提高植株抗病力。采用新土育苗和床土消毒，定植时用恶霉灵可湿性粉剂蘸根使用。发病初期喷淋或浇灌甲基硫菌灵胶悬剂或乙蒜素乳油进行灌根。

3、番茄灰霉病：灰霉病是大棚栽培番茄的重要病害，病菌主要侵害果实，侵染由残留的花及花托向果实或果柄扩展，使果皮成为灰白色水渍状，变软腐烂，以后再果面、花萼及果柄上出现大量灰褐色霉层，果实失水僵化。灰霉病也为害茎叶，成株期病斑始见于叶片，表面生少量灰霉，叶片最后枯死。

低温、高湿是发病的必要条件，尤其高湿是病害发生发展的主要因素，温度在15度左右，相对湿度80%以上为发病的起始条件，保护地在春季偶遇连阴雨天气，如不及时放风，棚内气温降低，湿度增大时，则本病严重发生，此外，植株密度过大，生长繁茂和管理不善均能促进病害发生发展。